Ну что я могу сказать - у меня WinXPsp3, декодер CoreAVC - всё скринится. И из твоего AVI, и из переделанного MKV. Значит виновата Win7 или может тот декодер, который у тебя просматривает это видео (Microsoft DTV-DV Video Decoder). А установленный из K-Lite у тебя просто не работает в данном случае.

правда скрины у меня вверх ногами

прикольно...
Думаю для таких проблемных видео надо делать скрины плейером и загонять их в CDC, как картинки. И не забивать голову виндовыми проблемами кои никто до конца решить не в состоянии....